根據用途的不同，DNA合成儀可分為實驗室型，工業型和大規模合成三種主要類型。

　　1、實驗室型：主要指合成通量較小，且單柱合成產物為10-1000nmol，一般為合成柱數低于48柱（含）的DNA合成儀，主要適用于化學生物學實驗室，或某些剛起步的商業機構。

　　2、工業型

　　工業型合成儀,主要指合成通量大，且單柱合成產物為10-1000nmol的DNA合成儀。工業型合成儀常見的合成柱數為96柱、192柱，384柱或更多合成柱數的合成儀較為鮮見。主要適用于大型實驗室，公用實驗平臺及商業合成機構。

　　3、大規模合成型

　　大規模合成型主要指單柱合成產物量可達數克，甚至數公斤的合成儀，主要用于原料藥制備等科研或商業用途。
 

　　DNA合成儀日常維護

　　1、瓶塞“O”形環

　　一月檢查一次“O”形環，至少1年更換1次。將新的備用“O”形環與DNA合成儀上的相比較，如果在“O”形環上出現白色沉淀，用棉花蘸取乙腈，進行清洗。更換“O”形環的步驟如下：用止血鉗夾住“O”形環，從槽中取下(或用牙簽鉤下)，注意不要損壞托住“O”形環的白色聚氟乙烯插塞(；確保插塞上沒有顆粒后，用手指將新“O”形環推進槽，進行壓力實驗。

　　2、儲液瓶

　　瓶子都要放在亞磷酰胺及儲液瓶位置上，并保持氬氣壓力以及管路清潔。

　　3、流路節流閥

　　為了防止阻塞，節流閥應該1個月清洗1次，清洗時，先在水中煮沸15分鐘，然后再在甲醇中超聲波清洗。